Вообще-то сдать справки 2-НДФЛ по сотрудникам ликвидируемого обособленного подразделения лучше до окончательного закрытия ОП по месту его нахождения. Но если это не сделано, справки сдать все равно придется, но уже в ином порядке.

Источник: Письмо ФНС от 01.04.2019 № БС-4-11/5938@

Так, в случае, если справки 2-НДФЛ не были представлены до снятия обособленного подразделения с учета, обязанность по представлению информации о доходах сотрудников закрытого ОП переходит головному офису.

Сдать справки нужно будет по месту учета налогового агента - головной организации в общеустановленные сроки. Т.е. не позднее 1 апреля года, следующего за годом, в котором «физиками» были получены доходы от ликвидированного ОП. Причем в справках 2-НДФЛ, представляемых в отношении работников закрытой обособки, указывается ИНН и КПП головного офиса, а ОКТМО закрытого подразделения.